存疑不起诉与相对不起诉的区别主要是起诉的条件不同，并且概念也是存在差异的。通常情形下，检察院若是在审查由公安机关侦查结束之后，提交上来的一切案件信息，存在疑惑，也就是案件证据不足，此时会发生存疑不起诉。
一、存疑不起诉与相对不起诉的区别是什么?
存疑不起诉与相对不起诉的区别主要是起诉的条件不同，具体区别如下：
1、存疑不起诉规定中包括两个条件：
(1)案件已经经过了补充侦查。这是对案件已经经过补充侦查，仍作不起诉决定的时机控制，也是作该决定的程序条件。一般而言，未进一步收集证据就认为不符合起诉条件。
(2)证据不足，不符合起诉条件的。这是指证据不足以充分证明犯罪嫌疑人的罪行，以至于即使提起公诉，法院经过开庭审理，也很可能会宣告被告人无罪。
人民检察院对此种情形下的犯罪嫌疑人作出不起诉决定的，必须同时具备上述两个条件。
根据最高人民检察院《规则》第286条的规定，具有下列情形之一，不能确定犯罪嫌疑人构成犯罪和需要追究刑事责任的，属于证据不足，不符合起诉条件：
(1)据以定罪的证据存在疑问，无法查证属实的;
(2)犯罪构成要件事实缺乏必要的证据予以证明的;
(3)据以定罪的证据之间的矛盾不能合理排除的;
(4)根据证据得出的结论具有其他可能性的。
2、绝对不起诉适用于以下七种情形：
(1)犯罪嫌疑人没有犯罪事实的;
(2)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(3)犯罪已过追诉时效期限的;
(4)经特赦令免除刑罚的;
(5)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(6)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(7)其他法律规定免予追究刑事责任的。
二、存疑不起诉属于绝对不起诉吗？
不起诉分为存疑不起诉、绝对不起诉、相对不起诉三种。
1、存疑不起诉
人民检察院对于退回补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，经检察委员会讨论决定，可以作出不起诉决定。
具有下列情形之一，不能确定犯罪嫌疑人构成犯罪和需要追究刑事责任的，属于证据不足，不符合起诉条件：
(1)、据以定罪的证据存在疑问，无法查证属实的;
(2)、犯罪构成要件事实缺乏必要的证据予以证明的;
(3)、据以定罪的证据之间的矛盾不能合理排除的;
(4)、根据证据得出的结论具有其他可能性的。
2、绝对不起诉
人民检察院对于符合下列情形之一的案件，经检察长决定，应当作出不起诉决定。
(1)、情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(2)、犯罪已过追诉时效期限的;
(3)、经特赦令免除刑罚的;
(4)、依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(5)、犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(6)、其他法律规定免予追究刑事责任的。
3、相对不起诉
人民检察院对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，经检察委员会讨论决定，可以作出不起诉决定。
根据以上信息可以知道，相对不起诉只是检察院怀疑证据不足时，也即存疑不起诉中的一种情形，任何存在疑惑的情形，检察院都可以提出实质性的要求，让公安机关的职员继续侦查的工作，也可以是检察院的职员自己侦查存疑的案件。