随着时代的进步和发展，虽然农业户口与非农业户口的差别越来越小，但二者的区别也不容忽视，具体分析如下：
一.教育方面，非农业户口获取优质教育资源门槛相对较低。
首先，农业户口是依靠自我的辛勤劳作，来生产粮食满足基本生活需求的农业户籍人口。而非农业户口是指没有良田耕地，需要依靠国家分配的口粮来生活的城市户口，这是在计划经济时代对于二者的定义。
其次在教育方面，虽然所有户口的孩子都享有，平等接受九年义务教育的权利，且不分性别、种族和家庭状况等。但对于一些比较优质的教育资源，还是会对非农业户口子女有所倾斜。例如农业户口若想就读一些重点学校，不仅门槛会比城市居民户口高一些，有时还需要缴纳一定的费用才行。
二.社保和低保待遇方面存在差别。
二者在社保方面，主要是养老保险、医疗保险和失业保险有较大差别。第一，在职工到达退休年龄后，农业户口只能按照政策进行一次性申领养老金，而非农业户口则可以按月领取。
而针对没有工作的人员，有些农村地区要比城市待遇好一些。例如一些农村会提前为所有45岁以上男士和40岁以上女士购买养老保险，其中村民只需要自己出三分之一的较低费用即可。村民在到达退休年龄后，每个月就可以领取相应的养老金。而非农业户口的无业人员，就只能自掏腰包购买养老保险。
第二，在医疗保险方面，非农业户口更占优势。通常来说，只要按照规定正常缴纳社保，非农业户口除了住院和门诊看病均可报销外，在其退休后还可继续享受相关符合规定的医疗报销待遇。而农业人户口仅是住院时才能报销，且还得是在职期间。
第三，农业户口能够领取到的失业保险金通常低于非农业户口。例如城市居民户口在失业后，按所在区域最低工资标准的百分之七十发放失业金，而农民工只能按照百分之四十领取。
此外依据现行政策，在低保待遇方面，非农业户口也会高一些。比如农业户口的低保人员，每月可以收到142元的低保费，非农业户口则可以享受300元每月的低保补贴。
三.就业和参军方面也有所差异。
在前期企业在招工时，会优先考虑城市户口人员。但随着社会进步，在人才为王的现代化科技时代，户口这个因素基本不会成为找工作的阻碍。在就业方面，农业户口与非农业户口最大的差别，可能就是城市推出的劳动再就业政策了。
另一方面无论是参军，还是退役后，非农业户口的福利待遇会更好。首先是参军时的优待金不同，例如城市户口义务兵，每年给予一万元，农业户口每年只有五千元。非农业户口士兵退役后，政府会安排相应的安置工作，而农业户口士兵就没有那么幸运了。
虽然非农业户口在许多方面，所享受的待遇会好一些。但农业户口有一个比较显著的优点是，能够拥有自己的宅基地和其它农田等土地。若有幸遇上政府拆迁，就可能会拿到一笔不小的拆迁赔偿款。且现在非农业户口转为农业户口，也不是件很容易的事情，在原则上是不被国家允许的。